Kao počinioci zločina počinjenih na području Čajniča su označeni pripadnici srpskih paravojnih i policijskih formacija.
Lokalne srpske vlasti u aprilu 1992. otpustile su policajce i smijenile mnoge Bošnjake s položaja u državnim ustanovama, postavile barikade na izlazu iz Čajniča i uvele kontrolu kretanja Bošnjacima u toj općini. (para. 616. Krajišnik, str. 226.)
Srpske vlasti su 1992. godine u Čajniču civile i bošnjačke nacionalnosti držale zatočene u tri zatočenička centra*. (para. 617. Krajišnik, str. 226.)
*Lovački dom “Mostina” [C9.1], Policijska stanica u Čajniču i škola
Sredinom aprila 1992., nekoliko civila Bošnjaka uhapšeno je i zatočeno u kontejneru za skladištenje uz Lovački dom “Mostina” na kojem su bili pripadnici paravojne grupe*, a koji su zatočene izvodili iz kontejnera i tukli ih. (para. 618. Krajišnik, str. 226–227.)
*paravojna grupa “Plavi orlovi”
Pripadnici paravojne grupe su 18. maja izvršili pokolj nad 30 zatočenika u kontejneru, navodno kao odmazdu za smrt srpskog vojnika koji je poginuo negdje drugdje. (para. 618. Krajišnik, str. 226–227.)
Nakon tog događaja, većina Bošnjaka je bila prisiljena da ode iz Čajniča. (para. 619. Krajišnik, str. 227.)
Početkom maja 1992., srpske snage, od kojih je dio bio u uniformama JNA*, a dio u policijskim uniformama, zauzele su u sadejstvu s paravojnim snagama bošnjačka mjesta na tom području , a bošnjačke kuće su opljačkalne i spaljene u više dijelova grada Čajniča. (para. 619. Krajišnik, str. 227.)
*Jugoslovenska narodna armija
Muslimanski vjerski objekti su uništeni u Čajniču od juna 1992. godine. (para. 620. Krajišnik, str. 227.)